MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL02

Total Repeats: 2675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014214	CCTC	2	8	116	123	0 %	25 %	0 %	75 %	297567865
2	NC_014214	TCT	2	6	155	160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
3	NC_014214	GGTCGT	2	12	233	244	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	297567865
4	NC_014214	CTC	2	6	399	404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567865
5	NC_014214	GCC	2	6	442	447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567865
6	NC_014214	CAG	2	6	450	455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567865
7	NC_014214	CGT	3	9	479	487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567865
8	NC_014214	CCTC	2	8	494	501	0 %	25 %	0 %	75 %	297567865
9	NC_014214	TGG	2	6	589	594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567865
10	NC_014214	CTG	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567865
11	NC_014214	GCC	2	6	650	655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567865
12	NC_014214	GGT	2	6	663	668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567865
13	NC_014214	GCC	2	6	717	722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567865
14	NC_014214	GGTT	2	8	776	783	0 %	50 %	50 %	0 %	297567865
15	NC_014214	AGC	2	6	864	869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567865
16	NC_014214	AGG	2	6	884	889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567865
17	NC_014214	GCAAG	2	10	890	899	40 %	0 %	40 %	20 %	297567865
18	NC_014214	CCT	2	6	959	964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567865
19	NC_014214	GGC	2	6	1031	1036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567865
20	NC_014214	GCG	2	6	1074	1079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567865
21	NC_014214	TTC	2	6	1116	1121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
22	NC_014214	GAC	2	6	1131	1136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567865
23	NC_014214	CAC	2	6	1299	1304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
24	NC_014214	TGC	2	6	1438	1443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567865
25	NC_014214	ACTCGG	2	12	1469	1480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297567865
26	NC_014214	ACG	2	6	1486	1491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567865
27	NC_014214	TTC	2	6	1521	1526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
28	NC_014214	TCT	2	6	1549	1554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
29	NC_014214	GCG	3	9	1597	1605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567865
30	NC_014214	CCA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
31	NC_014214	T	6	6	1844	1849	0 %	100 %	0 %	0 %	297567865
32	NC_014214	CAC	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
33	NC_014214	CGGG	2	8	1924	1931	0 %	0 %	75 %	25 %	297567865
34	NC_014214	G	6	6	1929	1934	0 %	0 %	100 %	0 %	297567865
35	NC_014214	CAC	2	6	1947	1952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
36	NC_014214	CGG	2	6	1970	1975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567865
37	NC_014214	GGT	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567865
38	NC_014214	CAC	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
39	NC_014214	TCC	2	6	2020	2025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567865
40	NC_014214	TTC	2	6	2067	2072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
41	NC_014214	TGA	2	6	2102	2107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567865
42	NC_014214	TCT	2	6	2149	2154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567866
43	NC_014214	CAGC	2	8	2195	2202	25 %	0 %	25 %	50 %	297567866
44	NC_014214	CAG	2	6	2256	2261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567866
45	NC_014214	CAG	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567866
46	NC_014214	GCGG	2	8	2364	2371	0 %	0 %	75 %	25 %	297567866
47	NC_014214	GC	3	6	2388	2393	0 %	0 %	50 %	50 %	297567866
48	NC_014214	G	6	6	2405	2410	0 %	0 %	100 %	0 %	297567866
49	NC_014214	CGG	2	6	2426	2431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567866
50	NC_014214	AGC	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567866
51	NC_014214	GCC	2	6	2491	2496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567866
52	NC_014214	C	6	6	2542	2547	0 %	0 %	0 %	100 %	297567866
53	NC_014214	AGCC	2	8	2550	2557	25 %	0 %	25 %	50 %	297567866
54	NC_014214	GCG	2	6	2590	2595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567866
55	NC_014214	TCCA	2	8	2605	2612	25 %	25 %	0 %	50 %	297567866
56	NC_014214	CG	3	6	2657	2662	0 %	0 %	50 %	50 %	297567867
57	NC_014214	CTC	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567867
58	NC_014214	CCG	2	6	2702	2707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567867
59	NC_014214	CGT	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567867
60	NC_014214	C	7	7	2741	2747	0 %	0 %	0 %	100 %	297567867
61	NC_014214	GCT	2	6	2770	2775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567867
62	NC_014214	TCC	2	6	2838	2843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567867
63	NC_014214	TCC	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567867
64	NC_014214	CAC	2	6	2946	2951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567868
65	NC_014214	GCC	2	6	2967	2972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567868
66	NC_014214	C	7	7	3009	3015	0 %	0 %	0 %	100 %	297567868
67	NC_014214	CCG	2	6	3182	3187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567869
68	NC_014214	CTC	2	6	3258	3263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567869
69	NC_014214	GGA	2	6	3278	3283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567869
70	NC_014214	TCC	2	6	3307	3312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567869
71	NC_014214	CTC	2	6	3384	3389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567870
72	NC_014214	CTC	2	6	3431	3436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567870
73	NC_014214	CCG	2	6	3446	3451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567870
74	NC_014214	CCGC	2	8	3457	3464	0 %	0 %	25 %	75 %	297567870
75	NC_014214	CGCTTG	2	12	3465	3476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567870
76	NC_014214	CCT	2	6	3493	3498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567870
77	NC_014214	GAT	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567870
78	NC_014214	CG	3	6	3528	3533	0 %	0 %	50 %	50 %	297567870
79	NC_014214	CAG	2	6	3536	3541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567870
80	NC_014214	CAAAA	2	10	3599	3608	80 %	0 %	0 %	20 %	297567870
81	NC_014214	TCG	2	6	3612	3617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567870
82	NC_014214	CCT	2	6	4119	4124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567871
83	NC_014214	CT	3	6	4171	4176	0 %	50 %	0 %	50 %	297567871
84	NC_014214	CGGG	2	8	4452	4459	0 %	0 %	75 %	25 %	297567871
85	NC_014214	CCT	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567871
86	NC_014214	GGGC	2	8	4524	4531	0 %	0 %	75 %	25 %	297567871
87	NC_014214	CTC	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567871
88	NC_014214	GAA	2	6	4722	4727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567871
89	NC_014214	AAAG	2	8	4734	4741	75 %	0 %	25 %	0 %	297567871
90	NC_014214	GCC	2	6	4760	4765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567871
91	NC_014214	GAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567871
92	NC_014214	GC	4	8	4857	4864	0 %	0 %	50 %	50 %	297567871
93	NC_014214	CGG	2	6	4909	4914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567871
94	NC_014214	AG	3	6	4919	4924	50 %	0 %	50 %	0 %	297567871
95	NC_014214	GCC	2	6	5598	5603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567872
96	NC_014214	TCC	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567872
97	NC_014214	CCT	2	6	5662	5667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567872
98	NC_014214	GCC	2	6	5670	5675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567872
99	NC_014214	CAG	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567872
100	NC_014214	CAC	2	6	5735	5740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567872
101	NC_014214	CAG	2	6	5748	5753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567872
102	NC_014214	CAG	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567872
103	NC_014214	CTG	2	6	5798	5803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567872
104	NC_014214	AGC	2	6	5838	5843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567872
105	NC_014214	ACC	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567872
106	NC_014214	CTC	2	6	5957	5962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567872
107	NC_014214	CCG	2	6	5972	5977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567872
108	NC_014214	CTT	2	6	5980	5985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567872
109	NC_014214	GCG	2	6	6017	6022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567872
110	NC_014214	ACC	2	6	6030	6035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567872
111	NC_014214	CAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567872
112	NC_014214	GGA	2	6	6252	6257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567873
113	NC_014214	ACC	2	6	6258	6263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567873
114	NC_014214	AGG	2	6	6328	6333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567873
115	NC_014214	CGC	2	6	6374	6379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567873
116	NC_014214	TCA	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567873
117	NC_014214	CGAG	2	8	6604	6611	25 %	0 %	50 %	25 %	297567873
118	NC_014214	CTA	2	6	6665	6670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567873
119	NC_014214	CGG	2	6	6686	6691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567873
120	NC_014214	C	6	6	6704	6709	0 %	0 %	0 %	100 %	297567873
121	NC_014214	A	6	6	6724	6729	100 %	0 %	0 %	0 %	297567873
122	NC_014214	G	6	6	6866	6871	0 %	0 %	100 %	0 %	297567874
123	NC_014214	CGC	2	6	6884	6889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567874
124	NC_014214	TCCCGG	2	12	6891	6902	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297567874
125	NC_014214	CCGC	2	8	6943	6950	0 %	0 %	25 %	75 %	297567874
126	NC_014214	AAC	2	6	6951	6956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297567874
127	NC_014214	CAG	2	6	6989	6994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567874
128	NC_014214	CCG	2	6	6995	7000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567874
129	NC_014214	CCA	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567874
130	NC_014214	TGG	2	6	7167	7172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567874
131	NC_014214	CTG	2	6	7184	7189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567874
132	NC_014214	CCT	2	6	7204	7209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567874
133	NC_014214	CCGC	2	8	7258	7265	0 %	0 %	25 %	75 %	297567874
134	NC_014214	CGGT	2	8	7287	7294	0 %	25 %	50 %	25 %	297567874
135	NC_014214	CGGT	2	8	7329	7336	0 %	25 %	50 %	25 %	297567874
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264	NC_014214	GGTA	2	8	12870	12877	25 %	25 %	50 %	0 %	297567887
265	NC_014214	CAC	2	6	12953	12958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567887
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383	NC_014214	G	7	7	19028	19034	0 %	0 %	100 %	0 %	297567894
384	NC_014214	GCGCAC	2	12	19062	19073	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	297567894
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386	NC_014214	GT	3	6	19342	19347	0 %	50 %	50 %	0 %	297567894
387	NC_014214	CAG	2	6	19464	19469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567895
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389	NC_014214	ACC	2	6	19584	19589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567895
390	NC_014214	GTG	2	6	19614	19619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567895
391	NC_014214	TTG	2	6	19635	19640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297567895
392	NC_014214	ACC	2	6	19644	19649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567895
393	NC_014214	GC	3	6	19714	19719	0 %	0 %	50 %	50 %	297567895
394	NC_014214	GC	3	6	19738	19743	0 %	0 %	50 %	50 %	297567895
395	NC_014214	CTC	2	6	19784	19789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567895
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400	NC_014214	CGG	3	9	20020	20028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567895
401	NC_014214	G	6	6	20059	20064	0 %	0 %	100 %	0 %	297567895
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403	NC_014214	CGG	2	6	20163	20168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567896
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498	NC_014214	GGCT	2	8	24417	24424	0 %	25 %	50 %	25 %	297567901
499	NC_014214	GCA	2	6	24448	24453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567901
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